Основне завдання системи водяного охолодження така сама, як і у повітряного: вона оберігає процесор від перегріву. Охолодний модуль СВО поглинає тепло процесора і відводить його за рахунок циркуляції води до радіатора, і далі за межі системи ПК.

Але найчастіше рідинне охолодження буде ефективнішим. Насамперед це пов'язано з тим, що вода має більшу теплопровідність, ніж повітря. Крім того, в СЖО знаходиться більший обсяг холодоагенту і він швидше циркулює за системою, а отже, краще охолоджує центральний процесор.

Більшість звичайних користувачів не потребує водяному охолодженні. Навіть ігровий ПК найчастіше не вимагає водяного охолодження – Досить звичайного баштового кулера. Справа в тому, що навіть дорогий процесор в ігровому ПК зазвичай не виділяє так багато тепла, скільки покриває Водяне охолодження.

Радіатори водяних систем охолоджуються звичайними вентиляторами.